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約翰·霍普金斯大學(xué)新冠疫情儀表盤將終止:中國博士生稱只是起點

2023年02月27日 15:01:36 來源:中國科學(xué)報 作者:孫滔

不久前,美國約翰·霍普金斯大學(xué)(JHU)通告稱,該校于2020年1月開發(fā)的用于跟蹤新冠疫情的儀表盤將于3月10日終止運作。

得知此消息,親手創(chuàng)建該儀表盤的董恩盛在朋友圈中寫道:“感謝大家的關(guān)注與支持!愿全球疫情早日完全結(jié)束!”

深黑底色點綴著或大或小的紅圈,左右兩側(cè)是各國確診病例、死亡和接種疫苗的數(shù)目,綠色、紅色或白色曲線十分醒目,3年來,這個儀表盤讓全球?qū)崟r看到詳盡、可視化的疫情地圖數(shù)據(jù)。2260億次點擊、超過36億次瀏覽,半年前的數(shù)據(jù)足以說明其影響力。

憑借此項工作,董恩盛的導(dǎo)師、 JHU土木和系統(tǒng)工程系教授Lauren Gardner入選了《時代》雜志2020年全球最具影響力百人榜,還獲得有“諾獎風(fēng)向標”之稱的2022年拉斯克獎。而這背后,離不開兩位中國博士生董恩盛和杜鴻儒的極大付出。

董恩盛和杜鴻儒。   JHU官網(wǎng) 圖


據(jù)統(tǒng)計,與儀表盤相關(guān)的、以第一作者署名的文章,董恩盛有4篇、杜鴻儒有1篇。其中一篇由他們與導(dǎo)師3人共同署名,2020年2月發(fā)表于《柳葉刀-傳染病》,引用次數(shù)超過9500次。

這篇正是介紹新冠疫情數(shù)據(jù)儀表盤創(chuàng)建的文章。而它只是一篇讀者來信,且僅有一頁多一點。更神奇的是,該文章僅用“72個小時寫稿,32個小時過審”。如果這是一篇研究論文,那這個引用次數(shù)的價值會更大。

按照谷歌學(xué)術(shù)的統(tǒng)計,董恩盛、杜鴻儒二人的引用次數(shù)已經(jīng)超過1萬。

這一切,卻是歷史的偶然。

“一不小心做成了一件大事”

“一不小心做成了一件大事。”2020年上半年,美國達特茅斯學(xué)院地理系教授施迅在與董恩盛的一次對話中,給出了這句由衷的評價。

時鐘撥回到2020年1月21日上午,董恩盛和導(dǎo)師Gardner如約來到圖書館喝咖啡交流課題。

彼時30歲的董恩盛作為一年級博士生,進入JHU僅10個月;而35歲的Gardner也是剛剛從澳大利亞新南威爾士大學(xué)悉尼分校跳槽過來,董恩盛、杜鴻儒是她僅有的兩位博士生。

董恩盛是Gardner在JHU的“開山大弟子”。早在2019年五六月份時,他就與Gardner針對美國麻疹暴發(fā)風(fēng)險做了一份可視化地圖,并得到《紐約時報》等美國主流媒體的關(guān)注。

董恩盛本科畢業(yè)于西南大學(xué)地理系,其間交換到臺灣中央大學(xué)地球科學(xué)系,于2012年赴美,在愛達荷大學(xué)拿到地理與統(tǒng)計雙碩士。在愛達荷大學(xué)就讀期間,他曾在地理信息系統(tǒng)公司Esri實習(xí)過,儀表盤技術(shù)就是在那里接觸到的。后來在選擇博士生導(dǎo)師時,董恩盛看中了Gardner從事傳染病數(shù)字建模的學(xué)術(shù)背景,這跟他地理信息系統(tǒng)、計算機和統(tǒng)計學(xué)的技術(shù)背景非常匹配,將有助于他未來從事建模研究。

這次跟導(dǎo)師見面談新學(xué)期計劃,董恩盛是有所準備的。彼時新冠疫情主要在中國、泰國、韓國和日本出現(xiàn)了少量病例,美國則剛剛確診了第一例。出于對中國疫情的關(guān)注和擔憂,也為了早點準備自己的博士課題,他已經(jīng)把疫情數(shù)據(jù)收集好,做了一個小樣。沒想到,當Gardner買了杯咖啡端過來時,她告訴董恩盛:“要不咱們做一個儀表盤疫情地圖吧。”

一拍即合!影響人類應(yīng)對新冠疫情的重要一環(huán)就此開啟。

Gardner后來坦陳,這個決定只是一時沖動。他們最初的想法是通過數(shù)據(jù)收集,把一種傳染病從發(fā)生到消滅的全過程記錄下來。

當天晚上,董恩盛熬夜奮戰(zhàn)八九個小時構(gòu)建了一個儀表盤。最初,這個流程并不復(fù)雜:收集、翻譯并整合全球來自各式各樣渠道的數(shù)據(jù),原始數(shù)據(jù)公布在Google Sheet上(后改為GitHub),之后使用地理信息技術(shù)和Esri的平臺對疫情數(shù)據(jù)進行空間可視化渲染。

杜鴻儒于2020年2月1日加入進來,負責數(shù)據(jù)的自動抓取、更新,并編寫了自動更新的代碼。當時25歲的杜鴻儒本科畢業(yè)于天津大學(xué)化工學(xué)院,在美國威斯康星大學(xué)麥迪遜分校獲得工業(yè)工程及運籌學(xué)專業(yè)碩士學(xué)位,他擅長數(shù)學(xué)模型和優(yōu)化。

兩人就此開始了聯(lián)手奮戰(zhàn)。隨著數(shù)據(jù)陡增,之后人手再度增加,有四五個人一起寫代碼,等自動地圖上線已是一周后凌晨三四點。

他們得到了來自本校學(xué)生、圖書館、JHU應(yīng)用物理實驗室,以及Esri公司的幫助。很快團隊擴大到了近40人。到當年4月,該儀表盤的日均點擊量超過10億次,最高達到了46億次。

在回顧這段經(jīng)歷的時候,Gardner說了一句,“不要等待許可, 坐下來并采取行動”。

作為旁觀者的施迅,對他們這段頗具傳奇性的開端很是感慨:要有這種開創(chuàng)性的勇氣,不要覺得自己只是一名學(xué)生做不成大事,而是應(yīng)該大膽去想、大膽去做,跟導(dǎo)師、同事請教,獲得支持,“在很多情況下,你會得到可能比你預(yù)想的多的支持”。

日常工作場景,左三為Lauren Gardner,左二為董恩盛,右二為杜鴻儒。  JHU官網(wǎng) 圖


流量取勝

紛至沓來的關(guān)注和榮譽遠遠超出了他們的預(yù)期。

董恩盛在朋友圈中記錄了一些激動時刻。

2020年:1月29日,他做的圖被BBC引用;2月29日,他們創(chuàng)建的儀表盤成為美國副總統(tǒng)、意大利總理決策的重要參考;3月12日,2013年諾貝爾化學(xué)獎得主、斯坦福大學(xué)結(jié)構(gòu)生物學(xué)系教授Michael Levitt來信對其工作點名鼓勵;3月20日,JHU校長看望疫情數(shù)據(jù)團隊;4月7日,《科學(xué)》雜志點名報道;5月被《華爾街日報》采訪;6月,同一天有兩篇系列文章被《柳葉刀》接收。

2021年:5月,儀表盤數(shù)據(jù)成為美國疾控中心的指定來源;7月,德國時任總理默克爾來到JHU接受榮譽博士學(xué)位時,贊揚了新冠疫情地圖的工作。

2022年:3月,《自然》雜志以新聞特寫報道了包括他們團隊在內(nèi)的新冠疫情數(shù)據(jù)工作;7月,《自然》雜志再次報道了各個疫情地圖團隊的技術(shù)特色。

他們的工作早已出圈。據(jù)說從制藥公司測試疫苗到好萊塢的電影拍攝,都會參考他們的儀表盤安排工作,以至于JHU被人們叫成了“map school”(地圖大學(xué))。

他們雖以流量取勝,但并非只靠流量。

當時,開展新冠疫情數(shù)據(jù)收集并可視化的機構(gòu)還有很多家,包括美國疾控中心、世界衛(wèi)生組織、《紐約時報》等。而JHU的疫情儀表盤之所以拔得頭籌,有眾多因素:由于數(shù)據(jù)收集和可視化做得專業(yè)且最早,因此獲得了先發(fā)優(yōu)勢;其數(shù)據(jù)抓取和更新及時、準確,一些國家和地區(qū)用戶會主動聯(lián)系他們更新數(shù)據(jù);JHU醫(yī)學(xué)與公共衛(wèi)生專業(yè)盛名的加持。

除了天時、地利、人和的種種因素外,在董恩盛眼里,對祖國疫情的關(guān)注和擔憂才是這個項目的第一推動力。

新的游戲規(guī)則制定者

讓世界上每一個人都能實時追蹤疫情,是他們最大、最重要的創(chuàng)新。

拉斯克獎給出的獲獎理由是,他們?yōu)閷崟r傳播權(quán)威公共衛(wèi)生數(shù)據(jù)設(shè)定了新標準。換言之,他們制定了新的游戲規(guī)則。

并不是所有疫情地圖制作者都始終秉持數(shù)據(jù)的公開、透明及非商業(yè)化。董恩盛還對施迅“抱怨”過,《紐約時報》用了JHU那么多無償?shù)臄?shù)據(jù),當他找《紐約時報》要數(shù)據(jù)時卻遭到拒絕。到了2020年3月,《紐約時報》才開始公布全部數(shù)據(jù)。

公開、透明及非商業(yè)化,也是Gardner最為看重的。她在拉斯克獎的獲獎感言中談到,這項工作更重要的意義是實現(xiàn)了數(shù)據(jù)民主化和科學(xué)傳播,這有助于公眾的知情決策,并促進以證據(jù)為基礎(chǔ)的公共衛(wèi)生政策的制定。

換個角度看,當JHU的儀表盤成為流量霸主的時候,它自然就成為了標準。法國的態(tài)度就是典型。疫情初期,董恩盛找法國要數(shù)據(jù),對方完全無視;然而到了后期,法國衛(wèi)生部發(fā)現(xiàn)JHU數(shù)據(jù)與其要公布的數(shù)據(jù)有偏差,就主動聯(lián)系溝通。

作為專業(yè)同行,施迅長期從事地理信息技術(shù)在健康領(lǐng)域的應(yīng)用,他深深感受到了這次全球大流行對傳染病研究的顛覆。在上世紀的西班牙大流感時代,診斷技術(shù)和信息技術(shù)過于原始,數(shù)據(jù)談不上準確;而這次新冠疫情全球大流行是一次史無前例的數(shù)據(jù)收集和整理的過程,這個過程本身就有巨大的科學(xué)價值。人們發(fā)現(xiàn),需要一些革命性的手段,重新建立對傳染病的認識并建模,而數(shù)據(jù)是這些手段的基礎(chǔ)。

董恩盛更是對大數(shù)據(jù)的影響感同身受:只有量變,才有質(zhì)變,才有進一步分析,才會帶來更多資金和人力資源的投入。他們的數(shù)據(jù)吸引的不僅僅是公共衛(wèi)生專家、計算機科學(xué)專家、地理信息專家,還有政治學(xué)者、經(jīng)濟學(xué)者,每個人都能挖掘到自己的“金礦”。

儀表盤只是起點

該和儀表盤說再見了。

這個背景是復(fù)雜的。JHU新冠資源中心(CRC)數(shù)據(jù)負責人Beth Blauer在接受采訪時分析說,一方面,由于居家快速檢測已廣泛使用,世界各地發(fā)布病例數(shù)據(jù)的實用性和準確性大大降低,儀表盤數(shù)據(jù)的準確性難以保障。另一方面,如美國聯(lián)邦政府的數(shù)據(jù)收集能力比之前已經(jīng)大大提高,尤其是其報告的住院數(shù)據(jù)成為如今最可靠和完整的決策依據(jù)。此外,由于許多國家的疫情趨于平穩(wěn),數(shù)據(jù)源的公布頻率和人們的關(guān)注度已大不如前。

Gardner用“苦樂交織”來形容過去的3年。她說,經(jīng)過3年日夜不休的維護,是時候改變已有的響應(yīng)模式了。

談起導(dǎo)師,董恩盛和杜鴻儒都不吝贊美之詞。

Gardner對信息接收和學(xué)生反饋的速度,最讓董恩盛欽佩不已。她能很快理解他人想表達的意思,然后給出意見。這在3年前兩人那次喝咖啡時表現(xiàn)得尤為明顯,當董恩盛提出深思熟慮了好幾天的意圖時,Gardner馬上就給出了做儀表盤的計劃。

實際上,Gardner在儀表盤上的貢獻是關(guān)鍵的,她會指出哪些數(shù)據(jù)更重要,需要在儀表盤上展示。同時,她需要把各種資源整合到這個項目中。

杜鴻儒感受更深刻的則是Gardner與學(xué)生的平等相處。她從來不會催著學(xué)生做任何事情,而是留更多時間給學(xué)生自由思考。

董恩盛的工作交叉性更強,他也更愿意做一些有實際應(yīng)用的事。接下來,他要把精力投入到博士課題中。畢竟疫情儀表盤的構(gòu)思源于其博士課題,所以他會繼續(xù)進行數(shù)據(jù)的挖掘,同時做一些網(wǎng)絡(luò)分析工作。

杜鴻儒的研究更偏理論,他正在利用收集的數(shù)據(jù)建立深度學(xué)習(xí)模型,尤其是關(guān)注人類行為數(shù)據(jù)和社會調(diào)查數(shù)據(jù)。他希望把人類行為對外界的反饋加入到傳統(tǒng)的流行病模型當中。他相信這種混合模型能對未來的疫情作出更準確的預(yù)測。

(原標題為《72小時寫稿,32小時過審,被引近萬次 來自中國博士生的“奇跡”》)


責任編輯:馮克萱
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